Ai fini dell'utilizzo della tecnologia di virtualizzazione è importante tenere conto del fatto che l'utente deve gestire sia il PC fisico che quello virtuale. Ogni PC richiede un certo livello di manutenzione, come ad esempio l’esecuzione del backup, l'aggiornamento del sistema operativo e delle applicazioni mediante l'installazione di patch, la protezione da virus, spyware e malware. Il firewall di Windows XP incluso nella Modalità Windows XP consente di applicare automaticamente gli aggiornamenti da Windows Update. Non è tuttavia presente software antivirus o antimalware, di cui è consigliabile disporre. Considerata la necessità di gestire la macchina virtuale, è consigliabile aggiornare le applicazioni affinché possano essere eseguite in modalità nativa in Windows 7, relegando l’impiego della Modalità Windows XP ai soli casi di effettiva necessità.