Ai fini dell'utilizzo della tecnologia di virtualizzazione è importante tenere in considerazione il fatto che l'utente deve gestire sia il PC fisico che quello virtuale. Ogni PC richiede manutenzione, come ad esempio l’esecuzione del backup, l'aggiornamento del sistema operativo e delle applicazioni mediante l'installazione di patch, la protezione da virus, spyware o malware. Il firewall di Windows XP incluso in Modalità Windows XP è preconfigurato in modo da applicare automaticamente gli aggiornamenti da Windows Update. Non è tuttavia presente software antivirus o antimalware, di cui è consigliabile disporre. Considerata la necessità di gestire la macchina virtuale, è consigliabile provare ad aggiornare le applicazioni affinché possano essere eseguite in modalità nativa in Windows 7, relegando l’impiego di Modalità Windows XP solo ai casi di effettiva necessità.