確かなセキュリティ機能を備えた Web サーバー を利用すれば、万全なウイルス対策のもとで安心、安全なインターネット接続が可能となります。また、OS として初めて「ファイアウォール」を標準装備した Microsoft Windows XP Professional をクライアントに利用すれば、さらなるセキュリティ強化が図れます。マイクロソフトでは Microsoft Windows XP Service Pack 2 セキュリティ強化機能搭載と呼ばれるパッケージを定期的に提供しており、常に革新的なセキュリティ強化機能と最新のセキュリティ更新プログラムを維持することができます。

カルテを含めた大量の紙を電子化することは、ペーパーレスによるコスト削減や、情報の容易な管理や検索を実現するだけでなく、「患者への適切な情報開示」が規定されている個人情報保護法への対応という観点において、電子化して一元管理することにより、患者さんに対して的確でスムーズな情報開示を行うことができる様になるので重要な意味を持っています。さまざまなサーバー機能を集約している Microsoft Windows Small Business Server 2003 なら、重要なデータを安全に保存し、必要に応じて自分の PC から情報を入手できるようになります。
また、紙の電子化はセキュリティを強化することにもつながります。その第一歩は、ID やパスワード、アクセス権限などを正しく設定すること。Microsoft Windows XP Professional には、こうした危険性を予防するための機能が標準装備されています。さらに、Microsoft Office Professional Edition 2003 の Information Rights Management (IRM) 機能を使えば、作成した情報の表示やコピー、印刷、転送する権限を持つユーザーなどを、高いレベルでドキュメントを保護、制御することができます。