Een belangrijke overweging bij het werken met virtualisatietechnologie is het feit dat de gebruiker zowel de fysieke als de virtuele pc moet onderhouden. Elke pc heeft een bepaalde mate van onderhoud nodig, zoals het up-to-date houden van het besturingssysteem en toepassingen met patches, beveiliging tegen virussen en ongewenste software, het maken van back-ups, en nog veel meer. Windows XP Mode is vooraf geconfigureerd met de Windows XP-firewall om automatisch updates toe te passen vanuit Windows Update. Windows XP Mode is niet vooraf geconfigureerd met beveiligingssoftware tegen virussen of ongewenste software, wat wel wordt aanbevolen. Omdat de virtuele machine moet worden onderhouden, adviseren we toepassingen zoveel mogelijk bij te werken zodat ze echt onder Windows 7 worden uitgevoerd, en Windows XP Mode alleen te gebruiken als dat nodig is.