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Windows 2000 Server 是唯一的伺服器作業系統，只有它整合了最關鍵的應用程式服務，這樣可以方便地建立功能強大的元件 Web 應用程式，包括：
應用程式服務
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COM+ - Windows 2000 Server Component Object Model (COM+) 提供整合的元件管理服務、物件間異動處理的進階支援以及伺服器間動態載入平衡的支援。這些整合的服務使開發和配置可升級的元件伺服器應用程式變得容易。
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功能強大的分散式應用程式服務
- Windows 2000 Server 可跨網路分散式管理。例如：訊息服務的佇列提供訊息佇列模式的寬鬆連接之可靠的網路通訊服務。這使得建立與整合在低廉的網路中運作的可靠應用程式變得較為容易。
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更佳的網站應用程式 - Active Server Pages (ASP) 提供了一個伺服器端的指令編輯環境，它能用 IIS5.0 建立和執行動態、互動的 Web 伺服器應用程式。使用 ASP 網頁， 開發者便可組織 HTML 頁，指令及 COM+ 元件來建立 COM 應用程式的 Web 介面。
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Web 就緒 - 所有的Windows 2000應用程式服務其核心皆為 Internet。這使組織的配置彈性有更大的空間，因為應用程式可使用於用戶端或 Internet 的環境。
終端服務
Windows 2000 Server 與終端機模擬服務整合，稱為 Microsoft 終端服務。終端服務利用存取完全在中心伺服器上執行的 Windows 應用程式來提供用戶端裝置。它提供傳統主機與終端機式的集中管理環境，為 Microsoft Windows 平台增添一分熟悉感、易於使用以及擁有應用程式支援。
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更迅速地將 Windows 2000 帶到桌面 -
「終端服務」 如同一個將桌上型電腦遷移到 Windows 2000 Professional 的橋樑性工具。它提供了一種簡易的方式把 Windows 2000 桌面真正地提供給非 PC 桌面和 PC，在它們能執行完整的Windows 2000作業系統之前仍需要升級硬體。
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支援Alpha
處理器的用戶端和伺服器 - 「終端服務」 完全支援 Alpha 處理器。使用 Alpha 版本的 Windows 2000 Server 和 Windows 2000 Professional 的公司可以使用「終端服務」。應用程式的集中配置。「終端服務」為 Windows 的終端機、遠端使用者或當地 PC 桌面提供 32 位元 Windows 應用程式的集中式配置和管理。「終端服務」確保所有的用戶端都能存取到應用程式的現行版本，因為軟體在伺服器上安裝一次，而不用在公司的每一台電腦上安裝。
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遠端管理 - 「終端服務」 為Windows 2000 Server 系列提供遠端管理。這給系統管理員一個透過 WAN 或撥號連線的用戶端裝置的遠端管理每一個 Windows 2000 系列成員之強而有力的方法。
通訊及網路服務
Windows 2000 為組織提供有效利用成本的方法，使組織利用簡易、有彈性的標準解決方案連線到用戶和網路。
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虛擬私人網路 (VPN) -
透過辦公室網路環境的模擬，Windows 2000 Server 讓移動的使用者仍能保持相當的工作效率。組織通過高效能的直接撥號或虛擬私人網路 (VPN) 連線簡易地擴展他們的私人網路。Windows 2000 VPN 支援允許組織安全地連接到分公司和夥伴的 Extranet。可靠的內建路由服務在區域或廣域網路以及跨 Internet 間提供 LAN-to-LAN 的路由。
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整合多媒體及資料網路服務 - Windows 2000 提供增強的全面通訊及目錄服務，就如同支援標準 H.323 和 IP 的多點傳送網路通訊協定。Active Directory 使 Windows 服務實現廣泛的原則管理，在支援主流媒體標準的同時增加系統之間交互運作的能力。這些進步以及服務品質和高頻寬連線的支援，使得 Windows 2000 成為整合多媒體和資料網路服務的理想平台。
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可擴展的通訊和驗證服務 - Windows 2000 支援可擴展的驗證通訊協定，主要是為了提供安全驗證給使用智能卡、token卡及生物裝置。透過可擴展的通訊和驗證服務以及對 RADIUS、L2TP 和 IPSec 通訊協定的標準支援，Windows 2000 提供了一個豐富、彈性及安全的遠端存取平台。
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