Esta aventura de acción sobrenatural se basa en la aclamada serie de Dark Horse Comics de Mike Mignola. Traído a la Tierra por el malvado genio Rasputín (Karel Roden) para ayudarles a los nazis en su causa mortal, Hellboy (Ron Perlman) fue rescatado por el profesor Broom (John Hurt), fundador del clandestino I.I.P.D. (Instituto para la Investigación Paranormal y de Defensa), que lo crió y desarrolló sus extraordinarios dones paranormales. A pesar de su oscuro origen, Hellboy se convierte en un insólito defensor del bien, luchando contra las fuerzas del mal que amenazan nuestro mundo junto con un "mer-man" telépata (Doug Jones) y una "piro-kinética" (Selma Blair). Escondidos de la sociedad, están designados para proteger. Son la principal línea de defensa contra Rasputín, quien busca volver a llevar a Hellboy al lado oscuro y usar sus poderes para desencadenar el Armagedón.