Do criador de Ghost in the Shell e do diretor de Appleseed surge a intensa prequela pós-apocalíptica, Appleseed: Alpha. Tendo que sobreviver numa sociedade pós-guerra mundial, dois soldados mercenários - Deunan e seu parceiro cibernético Briareos – são enviados em uma missão nos arredores de sua cidade destruída pela guerra. Durante a operação, eles conhecem Iris e Olsen, dois cidadãos da cidade utópica de Olimpo, que talvez tenham um jeito de salvar o mundo, mas o inescrupuloso Talos e o déspota maquinador Two Horns têm outros planos. Cabe a Deunan e Briareos proteger seus novos contatos e ajudar a salvar a última esperança da humanidade.