Den visionære instruktør Tim Burton står bag dette magiske eventyr, der er baseret på den populære bog af samme navn. Da Jake undersøger et mysterium med alternative virkeligheder, finder han en hemmelig verden for ”besynderlige børn” med overnaturlige kræfter. Men Jake finder hurtigt ud af, at der er farer overalt, og han må finde ud af, hvem han kan stole på, og hvem han selv i virkeligheden er.