Falling Skies beginnt mit den chaotischen Nachwirkungen eines außerirdischen Angriffs, der den Großteil der Erde völlig handlungsunfähig gemacht hat. In den sechs Monaten seit der ursprünglichen Invasion haben sich die wenigen Überlebenden außerhalb der Großstädte zusammengetan, um mit dem Widerstand zu beginnen. Jeder Tag ist ein Überlebenskampf, da die zivilen Kämpfer versuchen, die Menschen in ihrer Obhut zu schützen und gleichzeitig einen Aufstand gegen die Besatzer zu führen.