Mulder und Scully werden von den Fällen der “X-Akten” abgezogen. Statt ihrer müssen die beiden Agenten Jeffrey Spender und Diana Fowley die Untersuchungen übernehmen. Cassandra Spender kehrt zurück und informiert Mulder und Scully darüber, dass eine Alien-Rasse durchs Weltall reist, um fremde Planeten zu kolonisieren. Unter den potentiellen Planeten ist auch die Erde dabei, doch dies würde das Ende der menschlichen Zivilisation bedeuten…