Når en kjernefysisk ubåt synker i en avsidesliggende del av havet, blir en gruppe dykkere på en prototyp undervanns oljerigg presset av den amerikanske marinen til å utføre et redningsforsøk. Når en orkan ødelegger kommunikasjonen med overflaten, begynner mannskapet å finne bevis for uvanlig, muligens utenomjordisk intelligens. Mens Chief Bud Brigman (Ed Harris) krangler med sin ekskone og sjef (Mary Elizabeth Mastrantonio), begynner marinekommandøren å bli paranoid for den mystiske, ukjente livsformen og truer med å bruke et gjenfunnet kjernefysisk våpen for å ødelegge alt.