La série raconte la vie d'un service des urgences d'un hôpital parallèlement à celle d'un migrant. Avec Transplant, nous suivons Bash, un médecin syrien charismatique et talentueux qui a fui son pays déchiré par la guerre pour recommencer une nouvelle vie au Canada. Après avoir sauvé plusieurs blessés graves suite à un terrible accident survenu dans le restaurant où il travaille, Bash se voit offrir la chance de reprendre sa carrière de médecin. Il rejoint une équipe dans le service des urgences très animé d'un hôpital. Il doit relever plusieurs défis pour s'adapter à sa nouvelle vie, dans ce nouveau pays.