Caesar (Andy Serkis) en zijn apen worden gedwongen een dodelijk conflict aan te gaan met een leger mensen geleid door een meedogenloze kolonel (Woody Harrelson). Nadat de apen onvoorstelbare verliezen lijden, worstelt Caesar met zijn duistere instincten en besluit hij zijn soort te wreken, waarvoor hij het moet opnemen tegen de kolonel in een meeslepende strijd die het lot van beide soorten zal bepalen… en de toekomst van de planeet.