シーズン2はシーズン1のほぼ直後のシーンから始まる。救急医療科のチーフ、ジェッド･ビショップ医師が発作と思われる症状で倒れ、バッシュと同僚の研修医たちは動揺する。病院での生活は不安定になり、バッシュが自分の家だと思い始めていた場所は突如、落ち着かないものとなる。ヨーク記念病院のチームは家庭生活の問題に向き合いつつ、職場に新しい仲間を迎える。過去から思いがけない人物が登場したことで、バッシュはこの新しい世界への"移植"が成功したのかどうか、真剣に疑問を抱く。バッシュの努力･思いやり･有望さは、新しい環境で生き残るだけでなく最終的には成功する人間の能力についての普遍的な物語を語っている。