Il sequel del successo del 1997 Anaconda ha come protagonista Morris Chestnut, nei panni del rappresentante di una casa farmaceutica alla guida di una spedizione di scienziati nel Borneo, alla ricerca di un fiore che si presume contenga un siero della giovinezza. La spedizione, con una discutibile imbarcazione e un ancora più discutibile skipper americano (Johnny Messner), risale il fiume. Dopo coccodrilli, ragni, sanguisughe e una cascata, il gruppo si imbatte in un groviglio di enormi anaconda che campeggiano sulle agognate orchidee e che confermano le intuizioni sul fiore: quei serpenti, infatti, sono più grossi, veloci e furbi degli altri anaconda. Ma lo scienziato alla guida dell'imbarcazione, un odioso medico britannico (Matthew Marsden) vuole proseguire. Ben presto, per la sua avidità, farà un incontro mortale.