Pour la première fois dans la saga cinématographique de Spider-Man, l'identité du héros sympathique est révélée, opposant ses responsabilités de superhéros à sa vie normale et mettant en danger les vies de ceux qu'il aime. Lorsqu'il demande au Docteur Strange de l'aider à retrouver l'anonymat, le sort ouvre une brèche dans leur espace-temps, libérant tous les supervilains qui ont pu affronter Spider-Man par le passé. À présent, Peter doit surmonter la plus grande épreuve de sa vie, une épreuve qui va non seulement modifier son avenir, mais également celui du Multivers.